成都市儿童医院（以下简称儿童医院）设有住院病床200张，属二级甲等医院，设有免陪病房、ICU，是成都市儿童急救中心、四川省惟一一家综合性市级儿童医院。
地震发生时，尚有291名住院病儿及近千名门诊病儿。全体医护人员不顾安危，一次次冲进大楼，将病人疏散到安全地带，并实施及时救治；当时，一名来自广东的门静脉高压的病儿和一名来自眉山的“嫣然天使”基金的复杂唇、腭裂病儿的手术还未结束，在大楼的晃动中，经过大家的共同努力，手术总算顺利完成。
医院立即召开中层干部会，启动应急预案。疏散病人，将留院病人进行集中管理。按照成都市卫生局的要求，动员轻病人出院，预留100张床位为灾区病儿的收治作准备，安排部署抢救工作。
凌晨2:00，第一批5名灾区病儿从绵竹、都江堰转来。病情危重，外科主任胡显良马上带领医护人员进行手术。
儿童医院承担着成都市儿童急救中心的功能，所以不少来自灾区的重症儿童都被转到该院治疗。“比如苏菲菲（音），她是从都江堰送来的伤员，来的时候完全是血肉模糊，失血性休克。”儿童医院发展部副主任包奕凤说，苏在儿童医院进行了紧急抢救、输血，后来还是截肢了，现在还在ICU。
5月14日，儿童医院派了两个小组（每组7个人）到都江堰重展开搜救。当地4所学校和一家医院整体坍塌，基本没有找到幸存者。
一位校长告诉搜救队员，他自己也不知道孩子在哪所医院，情况怎么样。救治紧急，孩子们从废墟里救出来就马上运往各家医院，很多家长在这个过程中和孩子失去了联系，所以有很多家长到处找孩子。
为了使危重病儿得到更好的治疗，方便家属联系病儿，卫生局发文规定，在重灾区抢救出来的孩子只能转到华西医院、四川省人民医院和儿童医院。
5月15日17:20 分，儿童医院接到解放军47医院的电话，被告知该院有十余名灾区危重儿童急需转运救治。儿童医院立即派出3辆救护车，因需转运患儿童数量较多，病情危重，四川交通厅应急指挥中心派出两辆大客车增援，跟随救护车奔赴解放军47医院。
院长何杰、院党委书记胡蓉平亲自坐阵指挥，医院外科全体出动，数十名医生、护士、行政后勤人员主动请缨，志愿参加转运抢救任务。19:55，第一批16名危重儿童转运到儿童医院，医护人员、后勤人员被分成4人一组8支队伍进行救护，B超，照片，查血……太升路派出所获悉情况后，李涛副所长带领五名警官帮助维持秩序。21:33，第二批 6 名灾区危重儿童被送到医院。
在这次抗震救援中，儿童医院共收治了100名灾区病儿，手术97台次。
从灾区转运过来的孩子大都病情严重，儿童医院接收的孩子中有十几个已经被截肢。不少孩子有严重的挤压综合征，包括肾脏、肝脏衰竭，并发气性坏疽。
在救治灾区患儿的过程中，儿童医院碰到了跟其他医院一样的困难：医药、器械缺乏。
救治危重病人最需要的监护仪和呼吸机缺乏，止疼效果最好的疼痛棒不够。“要截肢的孩子疼痛感非常强烈，但是我们没有疼痛棒，只能用杜冷丁，”包奕凤说，“即使这样，也得十分节省，孩子痛了家长就给滴一点，能入睡，就关掉。”
在媒体进入医院以后，儿童医院就通过他们向社会各界呼吁，两台呼吸机、一台监护仪以及其他一些药械逐步到位，让医院在救治方面从容了很多。
对于病儿的心理干预，儿童医院很早就开始介入。5月15日，市卫生局派出的六名心理卫生专家来到儿童医院，对受灾孩子进行心理干预。北京、香港、台湾等外地救援队的心理专家，也来到医院给予支持。
此外还有很多来自各行各业的志愿者，“陪孩子玩玩，给他们讲讲故事，在心理上也是一个疏导。”包奕凤说，“但是从专家的角度讲，还是要先进行评估，找出问题，然后再进行干预。”
对灾伤儿童的救助应该是一个长期的过程，正是因为这一点，儿童医院通过晚报联系到了成都市一家白血病救助基金会，呼吁市民把捐款到该基金会，帮助孩子购买轮椅、拐杖等设施。
成都市政府和市卫生局一开始就规定，凡是灾区来的孩子，医疗费、生活费全免，孩子们的饮食得到了很好的保障。“一天三餐鸡蛋牛奶，每天下午三点钟还送一次水果，”包奕凤说，社会人士对孩子们更是关爱有加，他们给医院送来了洗发水、牙刷，“心很细很细”，甚至还有人送来了熬的鸡汤。
5月17日，儿童医院在官方网站上发布通告：“我院目前接受捐赠的食品，水，衣物已够，谢谢大家的爱心，感谢你们给予这些灾区儿童的帮助，感谢您们对医务人员的大力支持，谢谢！”
包奕凤呼吁：地震后前几天尽管天气非常热，来医院献爱心的人还是络绎不绝，希望社会对这些孩子的关爱，要持续下去。
现在医院只有包括苏菲菲在内的两名孩子，其他孩子都转移到了其他医院，还有一些孩子因为家里房屋倒塌，出院后被送到了市里的救助站。苏菲菲处于半植物人状态，因为妈妈在地震中去世，现在只有爸爸在陪着她。成都市规定，从7月1日开始，停止对灾区人员的饮食供应。对于苏菲菲父女，医院特例给他们供应饮食。
